| Verzia | 1.01 |
|---|---|
| Vydavateľ | Paul A. Wilson |
| Dátum vydania | 25. 8. 2008 |
| Dátum pridania | 11. 8. 2004 |
| Požiadavky OS | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Požiadavky | Mac OS X 10.3 |
| Celkový počet stiahnutí | 29 |
| cena | Free |
Popis
Nástroj príkazového riadka na porovnávanie dátových súborov oddelených čiarkami pomocou relatívnych rozdielov na určenie najpodobnejších konformácií. Compsort porovnáva dátové súbory pomocou relatívneho rozdielu, vypočíta skóre podobnosti, zoradí skóre vzostupne (nižšie hodnoty predstavujú väčšiu podobnosť), uloží X počet nízkych skóre.
Dátové súbory vytvorené používateľom musia byť textové súbory oddelené čiarkami. Každý súbor predstavuje jedinečnú molekulu. Každý riadok v súbore predstavuje jedinečnú konformáciu molekuly. Prvý stĺpec v dátovom súbore musí byť označenie jedinečné pre konformáciu reprezentovanú riadkom. Zostávajúce stĺpce sú číselné deskriptory, ako napríklad merania vzdialenosti.
Riadky sa porovnávajú kombinatoricky medzi súbormi. Porovnávané štítky sú zreťazené a uložené so skóre pre množinu riadkov. To poskytuje spôsob, ako identifikovať konformácie, ktoré vytvorili dané skóre podobnosti.
Budúca práca zahŕňa:
pridanie GUI rozhrania
uverejňujem článok o mojom algoritme 3D modelovania farmakofórov
Paralelná verzia využívajúca MPI
