GenoSuite
| Verzia | 2.0.1 |
|---|---|
| Vydavateľ | Dhirendra Kumar |
| Dátum vydania | 2. 5. 2013 |
| Dátum pridania | 2. 5. 2013 |
| Požiadavky OS | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Požiadavky | None |
| Celkový počet stiahnutí | 22 |
| cena | Free |
Popis
GenoSuite je rámec vyvinutý pre proteogenomickú analýzu. Stratégia založená na FDRScore sa používa na integráciu výsledkov z viacerých vyhľadávacích algoritmov. Prokaryotický proteogenomický nástroj (PPT) je vyvinutý ako súčasť rámca GenoSuite. PPT slúži na nájdenie nových prekladov v prokaryotických genómoch a závisí od proteomických údajov založených na hmotnostnej spektrometrii a súvisiacej sekvencie genómu. Funkcie zahŕňajú konfiguráciu pre 4 open source algoritmy na vyhľadávanie v databáze na identifikáciu peptidov a je možné zvoliť akúkoľvek kombináciu zo 4 algoritmov, uvádza zoznam peptidov špecifických pre vyhľadávanie genómu (nové peptidy), spektrálne zhody možno vizualizovať na posúdenie kvality, zoznamy môžu sa tiež vytvoriť nové proteíny a zmeny v existujúcich anotáciách proteínov a vizuálny genómový kontext nových peptidov.
