MultiGeneBlast
| Verzia | 1.1.5 |
|---|---|
| Vydavateľ | MultiGeneBlast |
| Dátum vydania | 3. 4. 2013 |
| Dátum pridania | 4. 4. 2013 |
| Požiadavky OS | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Požiadavky | None |
| Celkový počet stiahnutí | 95 |
| cena | Free |
Popis
MultiGeneBlast je open source nástroj založený na preformátovaní hlavičiek FASTA proteínových záznamov NCBI GenBank, pomocou ktorých dokáže vystopovať ich zdrojový nukleotid a súradnice. MultiGeneBlast môže pomôcť pri detekcii takýchto multigénových častí pre projekty syntetickej biológie. Syntetická knižnica operónov môže byť vytvorená na základe jej výstupu na identifikáciu tých operónov, ktorých funkcia je najbližšia tej, ktorú požaduje užívateľ. Tento nástroj poskytuje príležitosti na identifikáciu všetkých homológnych genómových oblastí kombináciou výsledkov jednotlivých behov BlastP na každom géne a triedením genómových oblastí z ľubovoľnej položky GenBank podľa počtu zásahov, zachovania syntény a kumulatívneho skóre bitov Blast. Je možné vykonať vyhľadávanie v architektúre, aby sa našli akékoľvek genómové oblasti s Blast zásahmi do akejkoľvek užívateľom špecifikovanej kombinácie aminokyselinových sekvencií.
