RightField

Popis

RightField môže špecifikovať rozsah povolených výrazov z vybranej ontológie (podtriedy, jednotlivci alebo kombinácie) pre každé pole anotácie. Výsledná tabuľka prezentuje tieto výrazy používateľom ako jednoduchý rozbaľovací zoznam. To znižuje prekážku prijatia pre používanie komunitných ontológií, pretože anotáciu vytvára vedec, ktorý generoval údaje, a nie tretia strana, a anotácia sa zhromažďuje v čase zberu údajov.

RightField je samostatná aplikácia Java, ktorá využíva Apache-POI na interakciu s dokumentmi spoločnosti Microsoft. Umožňuje používateľom importovať tabuľky programu Excel alebo vytvárať nové úplne od začiatku. Ontológie môžu byť importované buď z ich lokálnych súborových systémov, alebo z úložiska ontológie BioPortal. Jednotlivé bunky alebo celé stĺpce alebo riadky môžu byť označené požadovanými rozsahmi termínov ontológie a jednotlivá tabuľka môže byť anotovaná termínmi z viacerých ontológií.

Po označení a uložení tabuľka s podporou RightField obsahuje „skryté“ hárky s informáciami o pôvode a verziách ontológií použitých v anotácii. Tieto informácie o pôvode sú dôležité v prípade budúcich zmien ontológie, ktoré môžu znehodnotiť už zvolené hodnoty, alebo môžu pridať jemnejšie možnosti a rýchlu opätovnú anotáciu. RightField je určený ako nástroj správcu. Rozširuje tabuľky, ktoré už môžu zodpovedať špecifickým šablónam, aby sa ďalej štandardizovala terminológia.