CA

CodonCode Aligner

Vydavateľ: CodonCode Corporation
Virus scanned Windows Free to try
Stiahnuť ▼ v4.2.1 1.3K downloads
Verzia4.2.1
VydavateľCodonCode Corporation
Dátum vydaniaJun 21, 2013
Dátum pridaniaJun 21, 2013
Požiadavky OSWindows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
PožiadavkyNone
Celkový počet stiahnutí1 307
cenaFree to try

Popis

CodonCode Aligner je užívateľsky prívetivý softvér na zostavenie sekvencie DNA, zarovnanie, úpravu kontigov a detekciu mutácií. Aligner je kompatibilný s Phred-Phrap a plne podporuje skóre kvality sekvencií, pričom ponúka známe, ľahko naučiteľné používateľské rozhranie. Funkcie zahŕňajú import sekvencií z textových súborov, zarovnanie kontigov k sebe pri zachovaní odkazov na stopy, nájdenie heterozygotných mutácií, definovanie oblastí záujmu ("funkcie"), import a úpravu zostáv generovaných Phrapom, export sekvencií a prvkov, import sekvencií zo súborov ABI a SCF, orezávanie vektorov, zarovnávanie s referenčnou sekvenciou, analyzovanie heterozygotných inzercií a delécií, navigácia medzi používateľsky definovanými funkciami a exportovanie projektov zostavy kompatibilných s Consed.