| Verzia | 2.1.2 |
|---|---|
| Vydavateľ | BioSolveIT |
| Dátum vydania | 2. 5. 2013 |
| Dátum pridania | 2. 5. 2013 |
| Požiadavky OS | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Požiadavky | None |
| Celkový počet stiahnutí | 25 |
| cena | Free |
Popis
FlexS predpovedá konformáciu a orientáciu jedného z ligandov vzhľadom na druhý. Vo FlexS sa predpokladá, že referenčný ligand je rigidný, preto by mal byť podaný v konformácii, ktorá je podobná viazanému stavu. Algoritmus superpozície vo FlexS vyžaduje len malý manuálny zásah. Tieto znalosti môžete integrovať do výpočtov pomocou FlexS vykonaním jednotlivých krokov manuálne. FlexS je teda navrhnutý pre interaktívnu prácu s ligandovými pármi, ako aj pre virtuálny skríning založený na ligandoch. Dve hlavné aplikácie FlexS sú superpolohovanie ligandu (napr. pre CoMFA/QSAR) a virtuálny skríning. Ak máte proteín a malú molekulu, ktorá sa naň viaže (tzv. referenčný ligand), ale nemáte štruktúru proteínu, môžete referenčnú štruktúru považovať za negatívny odtlačok aktívneho miesta. FlexS určuje podobnosť medzi testom a referenčnou štruktúrou ich zarovnaním. Vo virtuálnom skríningu máte referenčný ligand a súbor zlúčenín a máte záujem uprednostniť zlúčeniny na experimentálne testovanie.
