ImageSurfer

Popis

ImageSurfer je bezplatný program na 3D zobrazovanie pre mikroskopiu. Umožňuje vyšetrovateľom vizualizovať a analyzovať viackanálové 3D a 4D (časozberné) objemy. ImageSurfer poskytuje niekoľko nástrojov na obnovenie obrazu vrátane algoritmov dekonvolúcie (Wienerov filter, obmedzená iterácia a maximálna pravdepodobnosť) na odstránenie rozmazania spôsobeného zobrazovacím systémom. Pre vizualizáciu poskytuje ImageSurfer niekoľko techník vykresľovania objemu a povrchu. Softvér má tiež inovatívny farebný režim isosurface, ktorý poskytuje kvalitatívne zobrazenie korešpondencie medzi dvoma kanálmi.

„Extraktor rezov“ umožňuje používateľovi preskúmať prierez objemu odobraný v akejkoľvek orientácii. Zachytený výrez je možné vizualizovať ako tradičný 2D obrázok alebo ako 3D reliéf, v ktorom je intenzita obrazu zakódovaná ako výška. Na ďalšie sondovanie priestorového prekrytia medzi štruktúrami môže výskumník pomocou údajov z iného kanála vyfarbiť 3D reliéfnu reprezentáciu. Na kvantifikáciu možno potom hodnoty intenzity signálu vzorkovať v zachytených rezoch pozdĺž používateľom definovaného spline. Okrem snímania snímok 3D reprezentácií a generovania filmov je možné 3D modely exportovať aj ako súbory OBJ alebo VRML (modelovací jazyk pre virtuálnu realitu); Súbory VRML je možné prezerať vo webových prehliadačoch pomocou bezplatného doplnku. Oba typy súborov je možné importovať do populárnych programov na vykreslenie 3D na ďalšie spracovanie a do aplikácie Acrobat 3D na vytvorenie dokumentov, ktoré je možné interaktívne zobraziť v aplikácii Adobe Reader 8.